Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc27Q3V036 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc27Q3V036 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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