Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pfdn4Q3UWL8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pfdn4Q3UWL8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pfdn4Q3UWL8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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