Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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