Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp19Q3UJD6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp19Q3UJD6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms