Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b2Q3UJB0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms