Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pid1Q3UBG2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms