Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf180Q3U827 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms