Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm6555-201ENSMUST00000195167 789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Olfr533-201ENSMUST00000071755 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Fam117bQ3U3E2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms