Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Kdm4dQ3U2K5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Kdm4dQ3U2K5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Kdm4dQ3U2K5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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