Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LcorlQ3U285 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms