Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms