Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms