Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc13Q3TIR1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc13Q3TIR1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms