Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms