Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd11Q1RNF8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samd11Q1RNF8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms