Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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