Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ptchd1Q14B62 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
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ptchd1Q14B62 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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ptchd1Q14B62 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ptchd1Q14B62 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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