Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Spatc1Q148B6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms