Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rundc1Q0VDN7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms