Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tigd2Q0VBL1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms