Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spata18Q0P557 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms