Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TrioQ0KL02 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms