Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms