Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
1700061G19RikQ08EE8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
1700061G19RikQ08EE8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms