Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgm3Q08189 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms