Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cdx4Q07424 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms