Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gdf3Q07104 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gdf3Q07104 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms