Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Siah1bQ06985 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms