Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Thbs3Q05895 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs3Q05895 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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