Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms