Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnb1Q03717 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnb1Q03717 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnb1Q03717 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnb1Q03717 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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