Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Thbs2Q03350 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms