Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nhlh1Q02576 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nhlh1Q02576 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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