Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Htr1fQ02284 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms