Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RykQ01887 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RykQ01887 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RykQ01887 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms