Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme2Q01768 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms