Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec23aQ01405 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms