Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SeleQ00690 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms