Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gabpb1Q00420 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Gabpb1Q00420 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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