Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pax8Q00288 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms