Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkp1P97350 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms