Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mesp1P97309 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Mesp1P97309 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mesp1P97309 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms