Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gabpb2P81069 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gabpb2P81069 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms