Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ptprn2P80560 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms