Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Otx1P80205 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms