Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SbdsP70122 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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