Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acta1P68134 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Acta1P68134 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Acta1P68134 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms