Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Ube2d2P62838 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms