Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vbp1P61759 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vbp1P61759 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Vbp1P61759 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Vbp1P61759 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Vbp1P61759 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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