Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PlnP61014 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PlnP61014 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PlnP61014 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PlnP61014 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PlnP61014 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PlnP61014 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PlnP61014 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PlnP61014 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PlnP61014 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms